Федеральное агентство морского и речного транспорта (далее — Агентство) является федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по оказанию государственных услуг и управлению государственным имуществом в сфере морского (включая морские торговые, рыбные, кроме рыбопромысловых колхозов, и специализированных порты) и речного транспорта.
Основные функции Агентства в установленной сфере деятельности:
а) оказание неопределенному кругу лиц на установленных федеральным законодательством условиях государственных услуг, имеющих общественную значимость, в том числе в целях реализации межгосударственных и федеральных целевых программ;
б) издание индивидуальных правовых актов на основании и во исполнение конституции Российской Федерации, федеральных конституционных законов, федеральных законов, актов и поручений президента Российской Федерации, правительства Российской Федерации и министерства транспорта Российской Федерации.
Агентство осуществляет также правоприменительные функции в сфере морского и речного транспорта в целях развития транспортного комплекса; осуществляет свою деятельность во взаимодействии с другими федеральными органами исполнительной власти, органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации, органами местного самоуправления, общественными объединениями и иными организациями.
Агентство осуществляет полномочия компетентного органа в области морского и внутреннего водного транспорта по выполнению обязательств, вытекающих из международных договоров Российской Федерации, в части выполнения функций по оказанию государственных услуг и управлению государственным имуществом.
В состав федерального агентства морского и речного транспорта входят управления:
- управление морской и речной деятельности;
- управление обеспечения судоходства;
- управление внутренних водных путей и инфраструктуры;
- управление экономики и государственного имущества;
- управление финансирования и бухгалтерского учета;
- организационно-правовое управление.
Агентство возглавляет руководитель, назначаемый на должность и освобождаемый от должности правительством Российской Федерации по представлению министра транспорта Российской Федерации. Руководитель Агентства несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Агентство полномочий.