На мировых картах в отдельных районах существуют значительные отступления в ходе изодинанам, т.е. искажения земного магнитного поля. Эти искажения поля называются магнитными аномалиями. Магнитные аномалии происходят от залежей под поверхностью Земли, пород, способных намагничиваться. К числу таких пород относятся в первую очередь минералы, имеющие в своём составе железо. Эти породы намагничиваются в магнитном поле Земли и создают добавочное магнитное поле, т.е. магнитную аномалию.Магнитные аномалии на картах обводят сплошной жирной чертой, внутри района указывают возможные колебания магнитного склонения. Если границы района определены недостоверно, то указывают пунктиром. Отдельные аномальные точки склонения обозначают звёздочкой с указанием наименования и значения склонения.
Наиболее крупной магнитной аномалией на земном шаре является Курская магнитная аномалия, образованная залежами кварцитовых магнетитов на глубине от 100 до нескольких сотен метров. В районе Курской магнитной аномалии Z доходит местами до 150 А/м. Магнитные аномалии имеются на морях Баренцевом, Белом, Балтийском, Чёрном, Охотском и др. Эти аномалии обозначены на навигационных картах.
